农业部脱毒马铃薯种薯质量监督检测测试中心于2001年通过农业部双认证评审，是经中华人民共和国农业部授权、国家计量认证的法定检验机构，为首批2个国家级马铃薯质检中心之一，“质检中心”承担全国脱毒马铃薯种薯质量检验、仲裁检验、委托检验、市场抽检和检测标准制定、修订等任务，并开展技术咨询，业务培训等相关工作。现已发展成为集脱毒马铃薯质量检验、科研和技术服务于一体的综合性质量监督检验机构。

2011年黑龙江省农业科学院土壤肥料检测中心通过了黑龙江省质量技术监督局的计量认证，是依法授权的第三方公正检验机构。综合化验室成立于1970年，投资600余万元，具有植物、土壤和肥料养分指标化验分析能力。该实验室的建成标志着我省在土壤测试和推荐施肥方面达到了国内先进水平，同时也是省内首家直接面向农业生产的“系统测土施肥”实验室。

黑龙江省农业科学院农业微生物检测中心2017年取得黑龙江省质量监督局认证认可。主要检测范围包括肥料、土壤和水体的微生物指标和蛔虫卵死亡率、粪大肠菌群数量等无害化指标。